Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP104O60308 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms