Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PPP6CO00743 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PPP6CO00743 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PPP6CO00743 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PPP6CO00743 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PPP6CO00743 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP6CO00743 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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