Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms