Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP29Q9HBJ7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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USP29Q9HBJ7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP29Q9HBJ7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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