Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCF25Q9BQ70 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms