Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNDC1Q96C34 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms