Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms