Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms