Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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RTL8BQ17RB0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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