Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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