Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXD4Q12950 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FOXD4Q12950 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FOXD4Q12950 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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