Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TM4SF4P48230 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms