Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINB3P29508 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINB3P29508 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINB3P29508 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINB3P29508 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINB3P29508 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINB3P29508 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms