Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB5P28074 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms