Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRAP18433 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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