Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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