Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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