Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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XCL2Q9UBD3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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XCL2Q9UBD3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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XCL2Q9UBD3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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