Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFIP11Q9UBB9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms