Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms