Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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