Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms