Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RAB18Q9NP72 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms