Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms