Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STAMBPL1Q96FJ0 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms