Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHFRQ96EP1 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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