Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A12Q504Y0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms