Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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