Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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CUL4AQ13619 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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CUL4AQ13619 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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CUL4AQ13619 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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CUL4AQ13619 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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CUL4AQ13619 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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CUL4AQ13619 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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CUL4AQ13619 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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CUL4AQ13619 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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CUL4AQ13619 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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