Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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