Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
STX4Q12846 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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STX4Q12846 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
STX4Q12846 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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STX4Q12846 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
STX4Q12846 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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