Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms