Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NUP62P37198 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NUP62P37198 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NUP62P37198 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NUP62P37198 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms