Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDI1P31150 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GDI1P31150 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms