Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINB3P29508 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINB3P29508 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINB3P29508 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINB3P29508 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINB3P29508 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINB3P29508 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINB3P29508 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINB3P29508 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERPINB3P29508 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERPINB3P29508 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINB3P29508 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms