Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms