Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms