Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms