Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms