Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCAO15360 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FANCAO15360 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCAO15360 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms