Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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