Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTF2Q9UNY4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms