Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBF1Q9UH73 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms