Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms