Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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