Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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PTP4A1Q93096 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PTP4A1Q93096 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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PTP4A1Q93096 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PTP4A1Q93096 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PTP4A1Q93096 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTP4A1Q93096 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTP4A1Q93096 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PTP4A1Q93096 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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