Protein–RNA interactions for Protein: Q93033

CD101, Immunoglobulin superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD101Q93033 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD101Q93033 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD101Q93033 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD101Q93033 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD101Q93033 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD101Q93033 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD101Q93033 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD101Q93033 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD101Q93033 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD101Q93033 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD101Q93033 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD101Q93033 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD101Q93033 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD101Q93033 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD101Q93033 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD101Q93033 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms