Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BEST4Q8NFU0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BEST4Q8NFU0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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