Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN4BQ8IWT1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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