Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms